濾毒式通風系統由除塵濾毒設備，進、排風機，管道，密閉閥門及消波設施等組成。當工程受到敵人核生化武器打擊，有人員急需進出工事，或室內CO2濃度升到1.5%以上，O2降到19%以下人員難以忍受時，并證明是該濾毒器能過濾的毒劑，且室外濃度較低時，才可以轉入濾毒式通風。濾毒式通風時，工程要超壓排風（全工程超壓排風或局部超壓排風），以防止工程外毒氣滲入工程內。超壓排風必須通過口部洗消間和防毒通道，以保證此時進出工程人員安全。濾毒式通風時，該管道上的密閉閥門必須與進、排風連鎖控制，以確保進、排風系統安全。